针对工资超过5000元未交税的赔偿问题，需先明确未交税的责任主体及具体情形。以下为您分情况说明：
工资超过5000元未交税的赔偿需区分责任主体，若为单位未代扣代缴，员工可向单位主张赔偿损失；若为员工个人未申报，一般无赔偿依据。

1. 若存在单位未依法代扣代缴个税的情况：单位作为扣缴义务人，未履行代扣代缴义务导致员工产生滞纳金、罚款等损失的，员工可要求单位赔偿该部分损失。
2. 若存在员工个人未主动申报个税的情况：因个人原因未申报导致的税务处罚，由员工自行承担，无法向他人主张赔偿。
3. 若存在双方均有过错的情况：如单位未代扣且员工未提醒，需根据过错比例分担损失。
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工资超过5000元未交税可能存在以下法律风险：
1. 税务处罚风险：若单位未代扣且员工未申报，税务机关可能对单位处以罚款，对员工追缴税款并加收滞纳金。例如，单位未代扣个税达1万元，税务机关可对单位处应扣未扣税款50%以上3倍以下罚款，员工需补缴税款并按日加收万分之五的滞纳金。
2. 信用影响风险：未及时缴纳个税可能影响个人信用记录，例如在办理贷款、信用卡时因税务不良记录被拒。
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工资超过5000元未交税的处理可能受以下特殊情况影响：
1. 员工与单位约定税后工资：若劳动合同约定工资为税后金额，单位未代扣个税导致的损失应由单位承担。例如，约定税后工资6000元，单位未代扣个税导致员工补缴税款，员工可要求单位赔偿补缴金额。
2. 员工属于非居民个人：非居民个人工资超过5000元的部分按规定缴纳个税，若单位未代扣，处理方式与居民个人一致，但需注意非居民个人的计税方式不同，可能影响赔偿金额计算。
3. 跨年度未交税：若未交税时间跨年度，可能涉及年度汇算清缴，需结合年度综合所得重新计算应纳税额，影响赔偿金额的确定。
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关于工资超过5000元未交税的赔偿问题，可依据《中华人民共和国个人所得税法》相关条款分析：
根据《中华人民共和国个人所得税法》第九条规定，“个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人”。若工资超过5000元未交税是因单位未履行代扣代缴义务，单位违反了法定扣缴责任，导致员工面临税务处罚或信用影响的，员工有权要求单位赔偿损失。例如，单位未代扣个税导致员工产生滞纳金，员工可依据该条款主张单位承担赔偿责任。若员工个人未主动申报，因个人未履行纳税义务导致的后果，需自行承担，无法律依据要求赔偿。

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